天然產(chǎn)物來源廣泛,具備多種治療潛力,已用于抗瘧疾(青蒿素)、抗腫瘤(紫杉醇)、鎮(zhèn)痛(嗎啡)和抗炎(阿司匹林)等藥物開發(fā)。然而,其低溶解性和生物利用度限制了臨床轉(zhuǎn)化,約90%的候選天然化合物因藥代動(dòng)力學(xué)問題被淘汰。
為克服上述限制,已開發(fā)包括納米粒、膠束、脂質(zhì)體和高分子水凝膠在內(nèi)的多種藥物遞送系統(tǒng)。其中,基于天然產(chǎn)物或其衍生物構(gòu)建的自組裝水凝膠因其良好的生物相容性、高藥物負(fù)載能力和可控釋放特性,成為炎癥治療、創(chuàng)面修復(fù)、抗菌和腫瘤治療等領(lǐng)域的潛在平臺(tái)。當(dāng)前,自組裝水凝膠的理性設(shè)計(jì)仍面臨挑戰(zhàn),主要原因在于缺乏對(duì)其分子結(jié)構(gòu)和組裝機(jī)制的理解。水凝膠通常以納米纖維或納米管等形式呈現(xiàn)多級(jí)結(jié)構(gòu),其形成依賴疏水/親水作用力的精確平衡。傳統(tǒng)結(jié)構(gòu)表征手段如負(fù)染電鏡(TEM)和原子力顯微鏡(AFM)雖可觀察納米尺度形貌,但無法解析分子間精細(xì)相互作用。
冷凍電鏡(cryo-EM)作為新興手段,已被用于蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)解析、肽-蛋白互作和超分子組裝研究,具備原子級(jí)分辨率,但在天然產(chǎn)物自組裝體系中的應(yīng)用仍較少,相關(guān)結(jié)構(gòu)機(jī)制研究尚不充分。
針對(duì)上述問題,湖南大學(xué)史俊峰/澳門大學(xué)宋賀團(tuán)隊(duì)合作發(fā)現(xiàn)姜皂苷R1(ZR1)可自發(fā)組裝形成分子水凝膠。冷凍電鏡結(jié)果顯示,該水凝膠由ZR1單體通過氫鍵驅(qū)動(dòng)形成納米原纖維結(jié)構(gòu),具備疏水性核心和親水性表面。相比游離態(tài)ZR1,水凝膠形式顯著增強(qiáng)其對(duì)白色念珠菌的抑制能力,表現(xiàn)為破壞菌體膜結(jié)構(gòu)并導(dǎo)致細(xì)胞內(nèi)容物泄漏。ZR1水凝膠可負(fù)載乳酸桿菌,在體外共培養(yǎng)體系中表現(xiàn)出對(duì)白色念珠菌的協(xié)同抑制作用。結(jié)構(gòu)分析顯示,ZR1水凝膠可通過分子間作用與念珠菌細(xì)胞壁葡聚糖結(jié)合,實(shí)現(xiàn)靶向識(shí)別。在小鼠VVC模型中,ZR1-乳酸桿菌復(fù)合水凝膠處理組菌落數(shù)顯著降低,陰道組織炎癥程度減輕,菌群結(jié)構(gòu)恢復(fù)趨于正常,表明該材料具備聯(lián)合抗真菌與調(diào)節(jié)陰道菌群的治療潛力。ZR1分子結(jié)構(gòu)中穩(wěn)定的氫鍵網(wǎng)絡(luò)為水凝膠構(gòu)建提供組裝基礎(chǔ),水凝膠平臺(tái)兼具抗真菌活性與益生菌遞送能力,為VVC治療提供新型干預(yù)策略,并為其他難溶天然產(chǎn)物的水凝膠化設(shè)計(jì)提供示范。該文章于2025年5月6日以《Atomic Insights lnto Self-Assembly ofZingibroside Rl andits Therapeutic Action Against Fungal Diseases》為題發(fā)表于《Advanced Materials》上(https://doi.org/10.1002/adma.202503283)。
(1)ZR1凝膠的制備與表征
ZR1在PBS中可通過加熱-冷卻法自組裝形成透明自支撐水凝膠,最低凝膠化濃度為2.0 wt%(圖1a)。負(fù)染TEM顯示水凝膠由寬度約5 nm的均一納米原纖維構(gòu)成,SEM觀察到內(nèi)部為多孔結(jié)構(gòu)(圖1b)。XRD分析顯示水凝膠具有明顯衍射峰,表明分子排列有序,而ZR1粉末中未見該結(jié)構(gòu)(圖1c)。FT-IR光譜顯示羧基O─H伸縮振動(dòng)增強(qiáng),C═O不對(duì)稱與對(duì)稱伸縮振動(dòng)紅移,提示氫鍵參與自組裝過程(圖1d)。ZR1水凝膠的zeta電位為 -38.3 ± 0.47 mV,顯示其穩(wěn)定性優(yōu)于游離態(tài)ZR1(圖1e)。流變學(xué)分析表明其具備典型的剪切稀化行為和良好的儲(chǔ)能模量恢復(fù)能力,表現(xiàn)出優(yōu)異的粘彈性能和自愈合特征(圖1f)。上述結(jié)果表明ZR1可自組裝形成結(jié)構(gòu)穩(wěn)定、力學(xué)性能良好、具有良好生物相容性和附著性的水凝膠,具備進(jìn)一步生物醫(yī)學(xué)應(yīng)用潛力。
圖1. ZR1凝膠的形貌與凝膠性能表征。(a)加熱-冷卻法制備ZR1水凝膠的示意圖;(b)ZR1凝膠的SEM圖像(左)和TEM圖像(右);(c)ZR1凝膠的XRD圖譜;(d)ZR1凝膠的FTIR光譜;(e)ZR1凝膠的Zeta電位測(cè)定結(jié)果;(f)ZR1凝膠在0.2%至500%應(yīng)變循環(huán)下的儲(chǔ)能模量(G′)恢復(fù)性能,頻率為1 Hz,凝膠濃度為2.0 wt.%
(2)ZR1納米纖維的低溫電子顯微鏡結(jié)構(gòu)
低溫電子顯微鏡(cryo-EM)結(jié)果顯示,ZR1分子可自組裝形成直徑約50 ?的管狀納米原纖維(圖2a)。2D分類顯示纖維片段具有約40 ?的周期性高分辨特征,寬度約為45.8 ?,提示其具備有序螺旋排列(圖2b)。功率譜分析觀察到延伸至4.3 ?分辨率的弱層線,第一層線與赤道間距對(duì)應(yīng)的螺旋重復(fù)單元為38.6 ?(圖2c),與2D圖像中重復(fù)結(jié)構(gòu)一致。根據(jù)功率譜索引結(jié)果構(gòu)建三維密度圖,初步解析ZR1納米纖維的螺旋結(jié)構(gòu)。因小分子缺乏典型二級(jí)結(jié)構(gòu),手性識(shí)別困難。通過分別在左手與右手螺旋模型中進(jìn)行原子構(gòu)建與實(shí)空間擬合,僅左手螺旋模型可容納ZR1手性結(jié)構(gòu),確認(rèn)其為左手螺旋。進(jìn)一步基于最佳擬合模型重構(gòu)獲得分辨率為2.5 ?的三維密度圖,其螺旋上升步長(zhǎng)為1.7 ?,扭轉(zhuǎn)角為?93.4°,形成螺距為154.4 ?的四股螺旋結(jié)構(gòu),投影重復(fù)單元為38.6 ?(圖2d,e)。該結(jié)構(gòu)清晰顯示出三萜核心與雙糖側(cè)鏈的電子密度,可構(gòu)建可靠原子模型(圖2f)。每個(gè)不對(duì)稱單元包含兩個(gè)ZR1分子,四個(gè)不對(duì)稱單元環(huán)繞納米纖維周向形成完整螺旋周期(圖2g)。
圖2. ZR1納米纖維的高分辨率冷凍電鏡結(jié)構(gòu)表征。(a)ZR1納米纖維的代表性cryo-EM圖像,箭頭指示其形貌;(b)2D分類圖像顯示具有約45.8 ?寬度的螺旋組裝結(jié)構(gòu);(c)功率譜圖及對(duì)應(yīng)的貝塞爾函數(shù)階數(shù)標(biāo)注,用于計(jì)算螺旋扭轉(zhuǎn)與上升步長(zhǎng);(d,e)從側(cè)視圖與頂視圖觀察的ZR1納米纖維密度圖,標(biāo)注纖維寬度與重復(fù)節(jié)距;(f)擬合左手螺旋結(jié)構(gòu)的ZR1原子模型(頂視圖);(g)不對(duì)稱單元內(nèi)的ZR1分子結(jié)構(gòu),包括兩個(gè)分子MolA和MolB
(3)ZR1凝膠體外表現(xiàn)出抗真菌活性
ZR1凝膠對(duì)白色念珠菌表現(xiàn)出顯著抗真菌活性。平板計(jì)數(shù)結(jié)果顯示,2.0% ZR1凝膠組菌落形成單位(CFUs)顯著低于同濃度溶液組,二者均低于未處理組(圖3a)。在接種密度為1×102至1×10? CFUs的系列測(cè)試中,ZR1凝膠在高密度條件下仍可有效抑制菌落生長(zhǎng),抑制效果優(yōu)于ZR1溶液(圖3b)。SEM觀察顯示,ZR1凝膠處理后白色念珠菌細(xì)胞形態(tài)破壞明顯,表現(xiàn)為細(xì)胞膜凹陷、破裂或變形;而未處理組細(xì)胞呈完整卵圓狀(圖3c,左)。TEM進(jìn)一步顯示,ZR1凝膠處理組細(xì)胞膜與細(xì)胞壁分離,胞質(zhì)物質(zhì)泄漏;對(duì)照組細(xì)胞結(jié)構(gòu)完整、胞質(zhì)均勻(圖3c,中、右)。共聚焦激光顯微鏡下的PI和Syto 9雙染結(jié)果表明,ZR1凝膠處理組細(xì)胞PI熒光顯著增強(qiáng),Syto 9熒光減弱,提示膜通透性增加,細(xì)胞膜完整性受損(圖3d)。上述結(jié)果說明ZR1凝膠通過破壞白色念珠菌細(xì)胞膜結(jié)構(gòu),增強(qiáng)其膜通透性,導(dǎo)致細(xì)胞死亡,從而發(fā)揮抗真菌作用。
圖3. ZR1凝膠的體外抗真菌性能。(a)ZR1凝膠處理后白色念珠菌的平板計(jì)數(shù)結(jié)果(n = 3);(b)不同初始接種量條件下ZR1凝膠對(duì)白色念珠菌生長(zhǎng)的抑制效果評(píng)估(n = 3);(c)ZR1凝膠作用4 h后白色念珠菌的SEM圖像(左)及TEM圖像(中、右);比例尺分別為2 μm、1 μm和100 nm;(d)ZR1凝膠處理30 min后白色念珠菌經(jīng)碘化丙啶和Syto 9染色的共聚焦激光顯微鏡圖像,比例尺為20 μm;*p < 0.05,**p < 0.01,***p < 0.001,ns表示差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義
(4)ZR1凝膠抗真菌特性的分子洞察
ZR1凝膠對(duì)白色念珠菌細(xì)胞膜的破壞效應(yīng)優(yōu)于游離態(tài)溶液,提示其納米纖維結(jié)構(gòu)可能在該過程中發(fā)揮關(guān)鍵作用。3D結(jié)構(gòu)分析顯示,ZR1分子沿螺旋軸方向通過羧基與羥基間的氫鍵穩(wěn)定排列(圖4a,b),三萜骨架朝向纖維內(nèi)核,表面暴露親水性雙糖基團(tuán)(圖4c),促進(jìn)纖維間氫鍵作用(圖4d),實(shí)現(xiàn)內(nèi)疏水、外親水的構(gòu)型(圖4e),有利于與細(xì)胞膜接觸與干擾。密度泛函理論(DFT)與獨(dú)立梯度模型(IGMH)分析顯示,ZR1與β-1,3-葡聚糖之間存在穩(wěn)定氫鍵,作用能為約?0.76 eV,表明其對(duì)白色念珠菌細(xì)胞壁具有較高親和力(圖4f)。分子動(dòng)力學(xué)模擬顯示,ZR1納米纖維可與POPC磷脂發(fā)生顯著相互作用(圖4g,h)。結(jié)果表明,ZR1納米纖維通過識(shí)別并結(jié)合細(xì)胞壁葡聚糖,將其錨定于真菌膜表面,進(jìn)而通過膜結(jié)構(gòu)擾動(dòng)實(shí)現(xiàn)抗真菌活性,呈現(xiàn)細(xì)胞壁識(shí)別與膜破壞的雙重作用機(jī)制。
圖4. ZR1納米纖維組裝在抗真菌活性中的分子機(jī)制。(a)ZR1納米纖維結(jié)構(gòu)模型側(cè)視圖;(b)螺旋軸方向上的分子間相互作用;(c)ZR1納米纖維頂視圖;(d)相鄰原原纖維間的分子作用模式;(e)ZR1結(jié)構(gòu)模型頂視圖,疏水原子以棒狀表示,極性原子以紅球表示;(f)ZR1納米纖維與β-1,3-葡聚糖相互作用的DFT計(jì)算結(jié)果;(g)分子動(dòng)力學(xué)模擬中ZR1凝膠與細(xì)胞膜相互作用的初始狀態(tài)與最終狀態(tài);(h)細(xì)胞膜在初始與最終狀態(tài)下的空間分布投影圖,X軸與Y軸表示膜模型的長(zhǎng)度(單位:納米)
(5)LGG@ZR1 可在小鼠體內(nèi)抑制 VVC
在小鼠外陰陰道念珠菌?。╒VC)模型中,ZR1凝膠和LGG@ZR1復(fù)合物展現(xiàn)出良好治療效果。雌性BALB/c小鼠經(jīng)雌激素預(yù)處理后陰道接種2 × 10? CFUs白色念珠菌建立VVC模型,感染確認(rèn)后連續(xù)9天給予不同治療,包括LGG、ZR1凝膠、LGG@ZR1復(fù)合物和伊曲康唑(對(duì)照藥物)(圖5a)。外陰觀察顯示,LGG@ZR1組在第5天炎癥顯著緩解,分泌物減少,紅腫消失明顯,優(yōu)于其他組(圖5b)。H&E和PAS染色顯示,LGG@ZR1組陰道上皮結(jié)構(gòu)完整,炎癥反應(yīng)及真菌殘留較輕,近似于健康對(duì)照組;PBS組表現(xiàn)為上皮結(jié)構(gòu)破壞和中性粒細(xì)胞大量浸潤(rùn)(圖5c,d),其他處理組仍存在真菌殘留,提示LGG@ZR1具備良好組織修復(fù)與抗真菌能力。16S rDNA測(cè)序結(jié)果顯示,LGG@ZR1組陰道微生態(tài)多樣性(OTU數(shù)、α-及β-多樣性)顯著高于伊曲康唑組,接近健康組水平(圖5e,f)。菌群組成上,LGG@ZR1處理顯著增加厚壁菌門(Firmicutes)比例,降低變形菌門(Proteobacteria)豐度(圖5g),恢復(fù)至更接近健康狀態(tài)的微生態(tài)結(jié)構(gòu)。綜上,LGG@ZR1在體內(nèi)表現(xiàn)出優(yōu)于伊曲康唑的抗VVC療效,具有抗真菌、抗炎、免疫調(diào)節(jié)及陰道微生態(tài)修復(fù)的多重功能,具備潛在臨床應(yīng)用前景。
圖5. LGG@ZR1對(duì)小鼠VVC模型的體內(nèi)治療效果。(a)VVC建模、治療與檢測(cè)的實(shí)驗(yàn)流程圖及不同處理組小鼠陰道外觀圖;(b)健康組、VVC模型組及LGG、ZR1凝膠、LGG@ZR1、伊曲康唑治療組小鼠的外觀圖像(n = 5);(c,d)各組小鼠陰道組織的H&E染色與PAS染色圖像,比例尺:100 μm;(e,f)各組陰道菌群的α多樣性(Chao)與β多樣性(PCoA)指數(shù),數(shù)據(jù)以幾何均值 ± SEM 表示(n = 5),P值采用Student’s t檢驗(yàn)計(jì)算;(g)各處理組在門水平的菌群相對(duì)豐度熱圖
本研究以低溶解性、低生物利用度的三萜皂苷類天然產(chǎn)物姜皂苷R1(ZR1)為模型,發(fā)現(xiàn)其無需結(jié)構(gòu)修飾即可自組裝形成水凝膠。采用冷凍電鏡解析了其納米原纖維的原子結(jié)構(gòu),分辨率達(dá)2.5 ?,為目前已報(bào)道的首個(gè)由天然產(chǎn)物自組裝形成并經(jīng)cryo-EM解析的納米纖維結(jié)構(gòu)。 ZR1自組裝后的三維結(jié)構(gòu)顯著增強(qiáng)其抗真菌活性,該構(gòu)象可富集有效分子,提升其與真菌膜的作用效率。纖維表面暴露的親水基團(tuán)促進(jìn)其附著于細(xì)胞膜,通過分子相互作用破壞真菌膜結(jié)構(gòu)。此外,ZR1水凝膠可負(fù)載益生菌乳酸桿菌,實(shí)現(xiàn)抗真菌與微生態(tài)修復(fù)的雙重功能。ZR1與益生菌協(xié)同抑制白色念珠菌,同時(shí)促進(jìn)陰道菌群恢復(fù),降低VVC復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn),提供更全面的治療策略。該水凝膠系統(tǒng)在治療口腔念珠菌病和真菌性腸炎等方面亦具有潛在應(yīng)用價(jià)值。 綜上,ZR1水凝膠是一種兼具抗真菌與益生菌遞送能力的多功能治療平臺(tái),其獨(dú)特的納米纖維結(jié)構(gòu)在生物活性增強(qiáng)中發(fā)揮關(guān)鍵作用,為天然產(chǎn)物在水凝膠構(gòu)建與藥物開發(fā)中的應(yīng)用提供了新思路,拓展了其在臨床干預(yù)中的潛力。
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